При пересадці волосся методом FUE другий етап – це відкриття каналів. Спеціальним лезом із сапфіровим наконечником лікар відкриває канали – робить розрізи на шкірі голови, в які пізніше будуть засаджені графти. Тут дуже важливим є досвід доктора-трансплантолога. Адже відкриття каналів потрібно робити під правильним нахилом і максимальною щільністю, щоб у майбутньому волосся було густим. Після того, як канали відкриті, починається посадка графтів у канали.
Метод FUE застосовується, коли пацієнт має великі зони облисіння, необхідно пересадити багато волосся з максимальною щільністю.